Desde 1989 se han realizado cuatro campañas oceanográficas que abarcan la mayor parte del ámbito íbero balear, principalmente en las regiones donde la fauna era menos conocida o donde existía especial interés biogeográfico. Estas campañas se han desarrollado a bordo del buque Oceanográfico García del Cid, del Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Su finalidad es la captura de representantes de toda la fauna existente, por ello, los muestreos son de carácter cuantitativo o semicualitativos. Se ha recogido una gran cantidad de material que, previamente separado en los laboratorios del Museo Nacional de Ciencias Naturales, está siendo estudiado por los especialistas en los diferentes grupos animales.

En estas campañas se ha hecho un gran esfuerzo en el apartado gráfico. Se han obtenido varios miles de diapositivas, muchas de ellas de animales desconocidos o conocidos sólo por algunas de sus partes duras. La mayoría de las diapositivas ya se han digitalizado. También se han rodado varias horas de película (video Hi8 y 16 mm)

Los números que se ofrecen a continuación, tanto de ejemplares como de especies, son meramente orientativos. Es preciso señalar que esta estimación se ha realizado muy por debajo de lo que deben ser los valores reales ya que aún no se ha incluido la microfauna habitante del sedimento.

Fauna I (julio de 1989):

La primera campaña se efectuó dentro del proyecto Fauna Ibérica I. Los muestreos tuvieron lugar en el Golfo de Cádiz, a ambos lados del Estrecho de Gibraltar, Mar de Alborán y Bajos de Motril. Se trataba de una zona de especial interés por la confluencia de tres regiones biogeográficas: Lusitana, Mauritana y Mediterránea, y de la que se disponía de escasa información. Participaron 13 personas entre investigadores y ayudantes. Las 80 muestras recogidas se tomaron principalmente entre los 60 y los 500 m de profundidad, recolectándose más de 25.000 ejemplares de al menos 800 especies diferentes. Se tomaron 1.300 diapositivas (de las que 242 corresponen a animales en vivo). También se rodaron cinco horas de película en video de los animales en acuario y de las actividades de la campaña oceanográfica. Con este material se ha montado un vídeo didáctico y divulgativo sobre dichas actividades.

Fauna II (junio de 1991):

Esta campaña se efectuó en el marco del proyecto Fauna Ibérica II. Se muestrearon las costas cantábricas, desde las islas Cíes (Pontevedra) hasta las costas orientales de Guipúzcoa y el Banco de Galicia. De esta área se disponía de escasa información y pocas colecciones, particularmente en el rango de profundidad entre los 30 y los 770 m (la profundidad máxima fueron 1.000 m). En la campaña participaron 19 personas entre investigadores y ayudantes. Se realizaron 95 lances entre pescas pelágicas y bentónicas. Se recolectaron unos 50.000 ejemplares de macrofauna pertenecientes a cerca de 2.500 especies diferentes. Se tomaron 2.000 diapositivas que aportan información hasta hoy desconocida sobre muchas de las especies recolectadas. También se realizó una película documental en 16 mm sobre el desarrollo de la campaña. Este documental, de nombre 'Maradentro', ganó el tercer premio de cine científico de la International Scientific Film Association (I.S.F.A.) celebrado en Zaragoza en 1992.

Fauna III (junio/julio de 1994):

Campaña desarrollada en el seno del proyecto Fauna Ibérica III. Se realizó en aguas de las islas Baleares y Banco del Emile Baudot (Sureste de Baleares) y, de forma muy puntual, se muestrearon los islotes Columbretes. La campaña se realizó de forma mixta, combinándose los clásicos lances de pesca de arrastre y pelágicos probados en campañas anteriores, con métodos más selectivos como son los que se emplean en muestreos con equipos de buceo autónomo. Su objetivo era realizar un exhaustivo muestreo biológico semicualitativo en estas zonas de las que se disponía de información parcial (prácticamente nula en el caso de las islas Columbretes) y de escaso material de colección. El rango de profundidad muestreado osciló entre 0 y 200 m (la máxima profundidad prospectada fueron 1.000 m). Se muestrearon un total de 99 estaciones (37 utilizando aparatos de buceo autónomo, 33 con Bou de Varas y 29 pelágicas utilizando diversos sistemas). Un primer balance de resultados realizado a la baja, arroja la cantidad de al menos 25.100 ejemplares recogidos de un mínimo de 1300 especies diferentes. En cuanto a material gráfico se han tomado 3.300 diapositivas y 13 horas de película de todas las actividades relacionadas con la campaña. Participaron 18 investigadores de diversos puntos de la geografía española.

Fauna IV (1996):

Esta campaña también se desarrolló en el marco del proyecto Fauna Ibérica III. Las zonas prospectadas fueron las aguas de los islotes Columbretes (provincia de Castellón) y Mar de Alborán. De forma muy puntual se muestrearon las islas Hormigas (provincia de Murcia). Participaron 19 investigadores. Esta campaña, como la anterior, se realizó de forma mixta, combinándose los clásicos lances de pesca de arrastre y pelágicos con muestreos con equipos de buceo autónomo. La finalidad de esta campaña era muestrear de forma semicualitativa y muy selectiva la fauna de las zonas mencionadas. Los rangos de profundidad prospectados estuvieron comprendidos entre los 0 y los 100 m en la zona de Columbretes y entre los 0 y los 500 m en la zona de Alborán. Se muestrearon 55 estaciones, 27 utilizando aparatos de buceo autónomo, 19 con Bou de Varas y 9 pelágicas utilizando diversos sistemas. Se recogieron más de 8.300 ejemplares de al menos 1.080 especies. En cuanto a material gráfico se han tomado cerca de 2.500 diapositivas de animales en su ambiente o en el laboratorio así como de diferentes actividades y se han filmado 5 cintas de video submarino (7 horas y media de película).